Как удобнее программисту воспринимать структуру так он и делает, что за бредовый вопрос?
Другой вопрос, если ты уверен что кроме тебя кто то будет пользоваться файлами, то лучше всё упорядочивать в логическом порядке и называть всё "говорящими" именами.

Ответ выше))

Папки:

Sys
Func
Img
Mod
Style

Коротко и понятно))